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- Actinomyxa order Microthyriales.
- Actinopeltis_(fungus) order Microthyriales.
- Arnaudiella order Microthyriales.
- Asterinella order Microthyriales.
- Asterinema order Microthyriales.
- Asteritea order Microthyriales.
- Asteronia order Microthyriales.
- Byssopeltis order Microthyriales.
- Calothyriopsis order Microthyriales.
- Caribaeomyces order Microthyriales.
- Caudella order Microthyriales.
- Cirsosina order Microthyriales.
- Cirsosiopsis order Microthyriales.
- Cyclotheca order Microthyriales.
- Dictyoasterina order Microthyriales.
- Govindua order Microthyriales.
- Helminthopeltis order Microthyriales.
- Hidakaea order Microthyriales.
- Hugueninia_(fungus) order Microthyriales.
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- Leptopeltidaceae order Microthyriales.
- Lichenopeltella order Microthyriales.
- Maublancia order Microthyriales.
- Microthyriaceae order Microthyriales.
- Microthyrium order Microthyriales.
- Muyocopron order Microthyriales.
- Pachythyrium order Microthyriales.
- Palawania order Microthyriales.
- Petrakiopeltis order Microthyriales.
- Phaeothyriolum order Microthyriales.
- Phragmaspidium order Microthyriales.
- Platypeltella order Microthyriales.
- Polycyclinopsis order Microthyriales.
- Polystomellina order Microthyriales.
- Resendea order Microthyriales.
- Sapucchaka order Microthyriales.
- Schizothyrium_pomi order Microthyriales.
- Scolecopeltidium order Microthyriales.
- Seynesiella order Microthyriales.
- Seynesiopeltis order Microthyriales.
- Stegothyrium order Microthyriales.
- Tothia order Microthyriales.
- Trichopeltella order Microthyriales.
- Trichopeltina order Microthyriales.
- Trichopeltospora order Microthyriales.
- Trichopeltum order Microthyriales.
- Trichothyriella order Microthyriales.
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